Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BECN2A8MW95 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BECN2A8MW95 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms