Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEURL1BA8MQ27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NEURL1BA8MQ27 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NEURL1BA8MQ27 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms