Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCNX2A6NKB5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCNX2A6NKB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms