Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC10BA6NIK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC10BA6NIK2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms