Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN8

Uncharacterized protein ENSP00000372125, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NCN8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A6NCN8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A6NCN8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A6NCN8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
A6NCN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A6NCN8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A6NCN8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A6NCN8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A6NCN8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A6NCN8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NCN8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NCN8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NCN8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
A6NCN8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms