Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VWA8A3KMH1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VWA8A3KMH1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms