Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PIPSLA2A3N6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PIPSLA2A3N6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms