Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PTPDC1A2A3K4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPDC1A2A3K4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTPDC1A2A3K4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms