Protein–RNA interactions for Protein: A1L157

TSPAN11, Tetraspanin-11, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11A1L157 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSPAN11A1L157 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSPAN11A1L157 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSPAN11A1L157 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms