Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E2F8A0AVK6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
E2F8A0AVK6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms