Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 LINC02521-201ENST00000440848 834 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL309P-201ENST00000491364 286 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC091544.2-201ENST00000555864 414 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MIR3689A-201ENST00000578854 78 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL678P-201ENST00000579533 299 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CSAG4-202ENST00000583763 237 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC244517.2-204ENST00000624802 415 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PTAR1-201ENST00000340434 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PARVA-201ENST00000334956 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ADCY1-201ENST00000297323 12503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TRNT1-202ENST00000280591 2180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RN7SL150P-201ENST00000462298 262 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SNRPD2-207ENST00000588599 805 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC130469.2-201ENST00000625112 1092 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SPDL1-216ENST00000629457 340 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 APTX-215ENST00000468275 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BHMT2-201ENST00000255192 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GPR12-201ENST00000381436 1981 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CHMP2A-201ENST00000312547 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AP001360.1-201ENST00000534055 518 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC092745.1-201ENST00000535746 603 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00592-201ENST00000549830 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PSME2-213ENST00000560410 755 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FGF11-205ENST00000575398 990 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF761-204ENST00000610928 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC00663-201ENST00000586645 1357 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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