Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PRDM11-204ENST00000530656 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CREB5-203ENST00000396299 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPOP42166 THEGL-202ENST00000512175 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TOP1MT-213ENST00000521193 1960 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ALDH1A2-204ENST00000537372 3700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SUCLG2-203ENST00000492795 1512 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NOSIP-204ENST00000596358 1005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ATCAY-205ENST00000600960 2904 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CCDC33-206ENST00000558821 1993 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CUTA-204ENST00000440279 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TMPOP42166 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TMPOP42166 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms