Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIRT1Q96EB6 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NBPF13P-201ENST00000444082 1783 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RPP30-203ENST00000413330 1004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01849-201ENST00000414647 517 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL928921.1-201ENST00000441033 708 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC007405.2-203ENST00000455988 547 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC016924.1-201ENST00000511512 501 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AP003469.2-201ENST00000524369 430 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC239600.1-201ENST00000603201 462 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC00963-216ENST00000623185 786 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC127526.5-201ENST00000637148 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SNHG14-218ENST00000553108 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LILRA4-201ENST00000291759 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 IL1RN-204ENST00000409052 1903 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC02125-201ENST00000512279 2198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SYCP3-203ENST00000392927 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HLA-DRA-202ENST00000395388 1280 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 MRPL19-203ENST00000409374 1076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 CNBP-202ENST00000441626 1040 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RN7SL681P-201ENST00000482763 292 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC106872.8-201ENST00000507651 684 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LINC02354-202ENST00000548564 573 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 LIN28B-AS1-204ENST00000636951 610 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PRAMEF20-202ENST00000602960 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 OLFML3-201ENST00000320334 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SIRT1Q96EB6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms