Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 RN7SL328P-201ENST00000484033 300 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SAP30L-AS1-202ENST00000519727 396 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC025048.4-201ENST00000589740 699 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL121845.4-201ENST00000613401 306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DAP3-203ENST00000421487 1470 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DTNBP1-204ENST00000462989 1010 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HTR4-210ENST00000521735 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC091114.1-201ENST00000522815 630 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC011092.1-201ENST00000533128 1047 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TTN-AS1-231ENST00000589434 1066 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TTN-AS1-270ENST00000630096 915 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RETREG3-203ENST00000585894 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 DDX6P2-201ENST00000619520 1455 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AZGP1-201ENST00000292401 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MTND6P7-201ENST00000433237 524 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RPL30P11-202ENST00000509114 358 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ATP5G1-209ENST00000514808 359 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GINS4-203ENST00000518671 1158 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 HPR-203ENST00000561690 634 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC02256-202ENST00000564670 543 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 AC009309.1-201ENST00000610262 460 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KIR3DL3-201ENST00000291860 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 FAM49B-220ENST00000522250 1647 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 LINC02226-201ENST00000501071 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 COQ4-202ENST00000372875 928 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 MAS1LP1-206ENST00000419416 1047 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ATRXP46100 CTLA4-203ENST00000427473 969 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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