Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 MMD2-203ENST00000406755 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 NWD1-206ENST00000552788 6964 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AREL1-201ENST00000356357 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 GRM4-204ENST00000535756 6670 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 MADD-209ENST00000406482 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 C2orf27AP1-201ENST00000618128 586 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 KCNMA1-265ENST00000639591 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CSPG4P12-201ENST00000558282 4853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
APOC1P02654 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AL109976.1-201ENST00000621919 5678 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 RNF115-202ENST00000582693 9117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
APOC1P02654 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms