Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 A1BG-AS1-203ENST00000594950 1718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK8P49336 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SLC25A30-207ENST00000539591 3608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MRPL27-201ENST00000225969 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HIST1H3H-201ENST00000369163 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TRBV20OR9-2-201ENST00000379435 416 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 DMKN-203ENST00000402589 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 OR7E37P-201ENST00000421076 897 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HNRNPA1P3-201ENST00000440968 551 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 EXTL3-AS1-204ENST00000523789 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 IFI27L1-209ENST00000555523 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 UBA52-214ENST00000599595 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 EVA1A-201ENST00000233712 1815 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ACR-201ENST00000216139 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC090403.1-201ENST00000584546 1352 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LIMS2-203ENST00000409254 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 RAB6B-205ENST00000486858 880 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 USP36-202ENST00000449938 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK8P49336 TMEM186-201ENST00000333050 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms