Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HMBS-202ENST00000392841 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 IGF2BP1-202ENST00000431824 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 FOLR1-201ENST00000312293 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 LINC01324-202ENST00000497379 838 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 ZBTB25-203ENST00000555424 565 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AC007728.3-201ENST00000602304 746 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 Metazoa_SRP.163-201ENST00000611926 277 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 AL669831.6-201ENST00000635557 837 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
POLD1P28340 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 GIMAP4-202ENST00000461940 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 CST2-201ENST00000304725 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 RPL15-202ENST00000354811 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ALDH7A1-203ENST00000413020 1126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC098934.2-202ENST00000438944 1033 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AL355309.1-201ENST00000442158 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 IGHVII-65-1-201ENST00000519992 302 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PTDSS1-206ENST00000522072 1112 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 OR7E126P-201ENST00000526217 888 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AKR1B1P7-201ENST00000587229 952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ARL14EPL-203ENST00000634632 642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC083841.4-201ENST00000637396 352 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 GMPR2-201ENST00000348719 1684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 AC073862.3-201ENST00000624597 1648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 TRMT61B-201ENST00000306108 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
POLD1P28340 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms