Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC005549.1-201ENST00000579438 1629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 VPS26A-203ENST00000395098 2554 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GRP-201ENST00000256857 848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC005822.1-201ENST00000414124 1034 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC022211.3-201ENST00000584339 400 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FOSB-203ENST00000443841 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SERF2-205ENST00000403425 690 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC019349.1-201ENST00000411759 476 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 PRADC1P1-201ENST00000412317 525 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ODF3BA8MYP8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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