Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 HNRNPA1P4-201ENST00000509706 756 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 SPRY4-AS1-206ENST00000515288 539 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
E2F1Q01094 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms