Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 WISP1-201ENST00000220856 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 HDAC8-201ENST00000373554 833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PPP1R2P9-201ENST00000378131 880 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IGKV3D-20-201ENST00000390270 445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IGHV1-2-201ENST00000390594 417 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MPDU1-203ENST00000396501 1125 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FAM238A-201ENST00000412114 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CSMD2-AS1-205ENST00000434181 655 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ADCY10-203ENST00000476818 703 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IGKV3-20-201ENST00000492167 400 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CLDN24-201ENST00000514470 663 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AP006287.1-201ENST00000533995 653 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CLDN24-202ENST00000541814 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PA2G4-206ENST00000552766 1085 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC009171.2-201ENST00000573220 318 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 MIR4686-201ENST00000584128 76 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IGHV1OR15-1-201ENST00000604066 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC135068.8-201ENST00000630556 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC25A19-201ENST00000320362 1651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TMUB2-214ENST00000590235 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RGPD4-AS1-202ENST00000457647 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 OR4A5-201ENST00000319760 1071 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CD59-205ENST00000437761 758 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RN7SL644P-201ENST00000577919 259 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC090844.3-201ENST00000583462 784 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC104440.1-201ENST00000605010 343 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 IPO7-208ENST00000630083 195 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CCDC144NL-AS1-216ENST00000582583 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FHL1-229ENST00000629039 1501 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CST8-201ENST00000246012 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 CYB5A-201ENST00000299438 718 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SERF2-202ENST00000339624 506 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC079988.1-201ENST00000432984 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LINC02166-201ENST00000567544 721 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TCEA3-203ENST00000450454 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 AMD1P4-201ENST00000299540 1345 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTPRMP28827 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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