Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SNAI1-201ENST00000244050 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 KRI1-201ENST00000312962 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 HJURP-204ENST00000432087 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC105935.1-203ENST00000419183 600 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 RABL2B-201ENST00000354869 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SNAP25-202ENST00000304886 2050 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 PCBP2-201ENST00000359282 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
GCAP28676 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PRPS2-202ENST00000380668 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 CLINT1-210ENST00000530742 3344 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 LRRC8E-206ENST00000618098 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PCLAF-201ENST00000300035 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PTPRD-AS2-201ENST00000429581 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PLXNA4-203ENST00000378539 2004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 ZNF814-215ENST00000614383 2006 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 XAB2-201ENST00000358368 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PAX6-207ENST00000379129 2614 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC021755.2-201ENST00000559022 461 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 KIR3DL1-201ENST00000326542 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
GCAP28676 TMEM174-201ENST00000296776 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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