Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PARP15-205ENST00000483793 4439 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL031666.1-201ENST00000413818 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ZFP69B-201ENST00000361584 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FAM177A1-201ENST00000280987 2927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RAB43-203ENST00000393305 4215 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LRFN5-201ENST00000298119 3723 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL606760.3-201ENST00000569869 3591 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 UNC93A-201ENST00000230256 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AC011495.2-201ENST00000600665 360 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ALOX5-207ENST00000542434 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
NICN1Q9BSH3 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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