Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 AC159540.1-201ENST00000422600 555 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LINC00332-201ENST00000455241 834 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 STEAP2-AS1-202ENST00000478318 627 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FAM223B-202ENST00000598177 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC004832.1-204ENST00000610737 1018 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PRKN-210ENST00000612540 603 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 GALNTL6-207ENST00000616459 1254 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FAM223A-202ENST00000625204 713 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SEPT4-203ENST00000393086 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC026725.1-201ENST00000511327 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC006144.1-201ENST00000424220 1600 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC009133.3-201ENST00000565600 1656 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FAM156A-203ENST00000611661 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MEOX1-203ENST00000393661 1206 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC006987.4-201ENST00000430032 279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL663070.1-201ENST00000438210 725 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 IQCF5-201ENST00000446461 512 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL354733.3-201ENST00000448389 390 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL353997.3-201ENST00000586597 589 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC013472.3-201ENST00000607407 659 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SH2D2A-203ENST00000392306 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CLDND1-223ENST00000511081 642 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CBX3P4-202ENST00000540428 423 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LINC00868-203ENST00000592919 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC023509.4-201ENST00000602306 775 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC069061.4-201ENST00000581294 1347 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LINC00523-206ENST00000556697 2071 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 CHEK1-203ENST00000428830 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SIRT1Q96EB6 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms