Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C1QTNF3-202ENST00000382065 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 GPR119-201ENST00000276218 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LAMTOR5-203ENST00000474861 1154 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC104435.2-201ENST00000478745 866 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC113391.1-201ENST00000507236 578 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 IGLVI-63-201ENST00000524184 384 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRMT112P6-201ENST00000599234 372 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LDLRAD1-203ENST00000420619 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PMP22-203ENST00000395938 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
RPS29P62273 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms