Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC009093.9-201ENST00000566038 1611 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GUCY1A3-205ENST00000506455 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDC27P30260 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 HACD3-201ENST00000261875 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MIPEPP1-201ENST00000413533 2027 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GLYR1-212ENST00000591451 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SERPINB8-209ENST00000636430 1719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GRM4-203ENST00000455714 2574 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DRD3-204ENST00000467632 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDC27P30260 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 IL18BP-202ENST00000337131 1606 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 EPB41L2-204ENST00000392427 3369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 YY1AP1-205ENST00000355499 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 DHRS7C-201ENST00000330255 1006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 MIR324-201ENST00000362183 83 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDC27P30260 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms