Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FAM114A2-211ENST00000520667 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCAP28676 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCAP28676 AIF1L-204ENST00000372300 3284 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
GCAP28676 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC107959.3-201ENST00000520840 484 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 NPIPP1-202ENST00000534799 1214 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 LINC01227-205ENST00000567317 1338 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 SLC25A19-210ENST00000580994 1554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 PLAGL1-209ENST00000444202 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ANKRD27-204ENST00000587352 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 SPRYD3-204ENST00000547837 1655 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 MATN2-218ENST00000524308 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL357509.1-201ENST00000641892 2013 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
GCAP28676 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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GCAP28676 AGO2-205ENST00000519980 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SIRPG-202ENST00000303415 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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GCAP28676 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 TSPAN6-201ENST00000373020 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SIRPG-204ENST00000381580 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL512378.1-201ENST00000394808 2100 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 IMPDH1P8-201ENST00000413639 1525 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SNX1-211ENST00000560829 1869 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 OPN1MW3-201ENST00000599405 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 CPEB1-212ENST00000616959 2009 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 RAB5B-211ENST00000628569 496 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 GREM2-201ENST00000318160 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
GCAP28676 AL135960.1-201ENST00000422216 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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