Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LILRA6-203ENST00000396365 1890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZSCAN5C-202ENST00000534327 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PABPC1P2-201ENST00000471997 1805 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ZNF143-203ENST00000396602 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC120114.4-201ENST00000623731 2194 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GALT-201ENST00000378842 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 EFHD1-204ENST00000410095 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 SCN8A-215ENST00000638820 3359 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 STXBP1-202ENST00000373302 3967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CUL4BQ13620 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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