Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 C3orf56-201ENST00000624688 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LINC01649-202ENST00000634255 1743 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TACC1-208ENST00000520340 1976 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 HINT1-204ENST00000506908 681 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ZCWPW1-208ENST00000490721 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TRAP1-201ENST00000246957 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 JAML-211ENST00000533261 1508 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 L3MBTL1-202ENST00000373134 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ARHGAP25-201ENST00000409030 2936 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TAF7L-202ENST00000356784 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SARS2-205ENST00000594171 1631 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 LUCAT1-201ENST00000511918 828 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 STRADA-204ENST00000392950 2778 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CKAP2-202ENST00000378034 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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