Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ARHGEF9-235ENST00000637723 2146 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
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PTPRJQ12913 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PTPRJQ12913 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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