Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 ZDHHC7-201ENST00000313732 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DACH2-201ENST00000373125 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC136604.2-201ENST00000500262 1966 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LINC01447-201ENST00000429010 2761 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZFAT-209ENST00000520727 4686 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TRAPPC4-214ENST00000533632 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FERMT2-201ENST00000341590 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 VPS52-218ENST00000482399 3338 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ANKRD34A-201ENST00000606888 3613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 EDARADD-202ENST00000359362 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 SLC2A9-208ENST00000506583 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PBOV1-201ENST00000527246 2506 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 STRADA-202ENST00000336174 2255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TRIM25-202ENST00000537230 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZFHX2-AS1-201ENST00000553985 2322 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CHST15-201ENST00000346248 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RGPD5-203ENST00000393283 3304 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GPATCH2L-212ENST00000557263 1458 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 PKP4P1-201ENST00000426801 2158 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 TSFM-204ENST00000454289 2192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
POLR2KP53803 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms