Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RBM17P4-201ENST00000558517 1192 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC051619.1-201ENST00000560007 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MIR4695-201ENST00000577305 74 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 IKBKE-202ENST00000579827 678 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC092301.1-201ENST00000601618 764 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC00694-202ENST00000634610 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 IGF2BP2-203ENST00000421047 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CYP4F12-201ENST00000324632 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 YAP1P1-201ENST00000401504 1393 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CNKSR3-204ENST00000479339 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 OR2T1-201ENST00000366474 1110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 KCNIP1-202ENST00000377360 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 HLA-DQB1-203ENST00000399082 1219 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL162724.1-201ENST00000437461 373 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL662791.4-201ENST00000445544 317 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC073089.1-201ENST00000457546 214 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC139495.2-201ENST00000514492 1087 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC073655.2-201ENST00000551941 796 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC026254.3-201ENST00000584490 322 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CIAPIN1P-201ENST00000584883 931 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 CCDC181-201ENST00000367805 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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PTPRMP28827 RN7SL454P-201ENST00000492744 243 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AP001922.3-201ENST00000524768 842 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SDHD-204ENST00000528021 1071 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 SSPN-207ENST00000540266 587 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 AL391152.1-201ENST00000554160 1111 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC02253-202ENST00000560314 565 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PTPRMP28827 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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