Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CREB5-205ENST00000409603 1944 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SERINC4-201ENST00000299969 2318 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC026725.1-201ENST00000511327 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 NDUFB8-203ENST00000370322 713 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 HYKK-201ENST00000388988 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AL158847.1-201ENST00000431955 808 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC022239.3-201ENST00000528629 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AL589843.2-202ENST00000602289 740 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNRD1ASP-215ENST00000425604 1986 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 UEVLD-213ENST00000543987 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CYFIP2-222ENST00000620254 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 BCKDHA-202ENST00000457836 1745 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PES1P1-201ENST00000508165 1736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC133919.3-201ENST00000621407 1804 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P30-202ENST00000440699 997 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AL669970.2-201ENST00000446184 280 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC015911.7-201ENST00000587542 958 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC092069.1-201ENST00000589120 270 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC011479.2-201ENST00000598146 432 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 COQ5-201ENST00000288532 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 FAM45BP-201ENST00000408950 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC00189-201ENST00000420364 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SMIM17-201ENST00000598409 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AL139424.2-202ENST00000641335 1369 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 WDSUB1-204ENST00000409124 1600 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 ALOX5-208ENST00000612635 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CDKN2AIPNLP2-201ENST00000274516 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 DCAKD-202ENST00000342350 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 MAGEB10-201ENST00000356790 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 TRMT11-202ENST00000368332 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 RNF113A-201ENST00000371442 1353 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 CA6-203ENST00000377443 1319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHKAPQ2M3C7 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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