Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ADPRH-204ENST00000478399 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EXOC5-202ENST00000413566 8513 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FAM46A-202ENST00000369754 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 FER1L5-204ENST00000623019 6477 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 EPB41L1-212ENST00000441639 5967 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TMEM225BP0DP42 AC008764.8-201ENST00000623966 2717 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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