Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC4Q9Y696 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC4Q9Y696 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC4Q9Y696 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms