Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNFRSF18Q9Y5U5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TNFRSF18Q9Y5U5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms