Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FARP1Q9Y4F1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FARP1Q9Y4F1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms