Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP3Q9Y446 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP3Q9Y446 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms