Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TPRKBQ9Y3C4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TPRKBQ9Y3C4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms