Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MED16Q9Y2X0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED16Q9Y2X0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms