Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CHKBQ9Y259 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHKBQ9Y259 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHKBQ9Y259 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms