Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HIGD1AQ9Y241 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HIGD1AQ9Y241 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms