Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNTN6Q9UQ52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTN6Q9UQ52 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms