Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
AGAP1Q9UPQ3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AGAP1Q9UPQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms