Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTF2Q9UNY4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTF2Q9UNY4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.9 ms