Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHA7Q9UN72 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCDHA7Q9UN72 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms