Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULY5

CLEC4E, C-type lectin domain family 4 member E, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4EQ9ULY5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLEC4EQ9ULY5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLEC4EQ9ULY5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms