Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT6Q9ULM6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNOT6Q9ULM6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms