Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDH9Q9ULB4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDH9Q9ULB4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms