Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYH13Q9UKX3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYH13Q9UKX3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms