Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM4Q9UKN5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM4Q9UKN5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms